在台灣議論南海政策，長期來受到政府刻意忽略、內部政治對立和美中相互拉力的影響，大多都是盲目毫無國家利益為著眼點的。論述都欠缺對南海周邊現實形勢和台灣主場進行深度理解的立論基礎，反而多從藍或綠的政治角度探索，進行剖析南海問題研究的政治導向性，並偏頗依託在靠美國或是親大陸的立論點上，完全忽略台灣主場的國家利益基礎點何在。台灣在南海的國家利益應如何界定？對政府而言，的確是一項嚴肅的挑戰。
 
尤其長年來，對於南海其他聲索國的各種侵權行動，不去問是否違反或衝擊我國的南海政策基礎，我國應當如何立即回應以保護國家權益，反而先探問美國會如何反應？是否會對我國政府的回應作為有不同表態來決定政策作為？久而久之，朝野政治人物和評論者都習於探問美國的南海立場為決策的依據，美國國家利益已儼然是台灣應當遵循的方向。
 
2013年1月菲律賓政府在美國全力協助之下，提高南海主權爭議走向法理的挑戰路線，針對中國大陸提出南海仲裁案，試圖要否定大陸所主張的南海「九段線」合法性，以爭取在聯合國海洋法公約體系下，其所主張在南海擁有更多的海洋權益。台灣的論事者卻開始更關心美國要台灣出面澄清南海「十一段線」的原始意義和證據，面對兩岸關係的微妙處官方立場明確否定兩岸合作的可能性，對於仲裁案可能對台灣所產生的政策負面效應，政府和我們的社會幾乎都是事不關己的冷感以對。台灣社會顯然不知南海仲裁案的核心挑戰雖然是衝著北京而去，但卻直接威脅著台北繼續主張南海主權的政策基礎。
 
此時談論南海問題與兩岸合作共同因應仲裁案的挑戰，在台灣卻被盲目的民粹給模糊掉真正的重要性，透過輿論鼓譟民進黨要不要放棄南海主權。民進黨總統候選人蔡英文強調一旦執政，其南海政策主要內涵：將期待與區域國家進行對話，以外交方式化解南海潛在衝突；強調致力遵守國際法和聯合國海洋法公約，堅持在公海上的航行自由權，不接受任何挑釁行為。其中雖未明確具體作法，但因幾乎完全呼應美國的南海政策立場，就立即引起各方質疑民進黨恐會放棄南海主權，在美中之間倒向美國，而衝擊兩岸關係。這種論斷的導向完全未能將南海的現實形勢挑戰與危機納入整體南海問題論述的內涵中，這其實應該才是今日台灣面對南海的真正危機所在。
 
當前應該要如何因應南海仲裁案的作為更是政府和各界需要重視的大局，因為我政府長期以來南海政策的基礎就是持「十一段」線的主張，在這國際的法理鬥爭過程中，台灣能做的努力恰好就與大陸是並行不悖的方向，明確採取保障南海主權的動作形成兩岸共利的結果，也可保障暨有的主權主張，以及穩固政策的基礎。台灣當前的最大盲點就是兩岸關係在南海問題中的重要性被刻意忽略，所以，在這努力回應仲裁案的挑戰過程中，必須要照顧好對外關係與複雜的兩岸關係，政府更需要擺脫民粹思維，確實認識南海問題與兩岸關係難以分割的重要情結，才能維護台灣的國家利益。