臺灣2016年選舉最終以國民黨慘敗、民進黨大勝落下帷幕，這次選舉大致有以下幾個觀察點值得注意：
 
一是臺灣政治生態中的藍綠政治版圖和傳統結構大幅鬆動。蔡英文大贏朱立倫300多萬票，這也是臺灣全面開放總統選舉以來差距最大的一次。特別是在國民黨候選人朱立倫的大本營新北市以及之前執政的桃園市等區域，藍軍也是大敗的結局。此種局面不僅令藍營上下錯愕，更是藍綠結構大幅位移的重要表現。從這次選舉的開票結果來看，國民黨在全台除南投及離島的金門、馬祖之外，幾乎都是大輸對手民進黨。
 
二是藍綠結構是否全部瓦解，傳統分析臺灣政治和選舉的藍綠分析模式是否已不適用？從九合一選舉到這次選舉結果來觀察，臺灣社會長期存在的藍綠結構似乎不復存在，全然崩解。但如果從選舉的數字來分析，其實還不易把結論下得過早。較之蔡英文2012年的得票數，其實她也只是增長了80萬票而已。這說明在本次選舉中，民進黨和蔡英文在總統選舉中的支持度增長非常有限，但最終為何還大勝朱立倫300萬票，主要還在於藍軍支持者對國民黨和朱立倫的集體情緒性抵制，或者說泛藍民眾對馬英九和國民黨的不滿情緒在九合一選舉中並沒有發洩完。從另一個來看，民進黨的大贏在很大程度上只能說是建立在藍軍整體對國民黨的不滿情緒和某種處罰，所以最終選擇了不去投票的失望甚至絕望之作法。
 
三是在此次選舉中大敗的國民黨未來能否再起，恐怕還需要觀察，不宜過早下結論。2008年馬英九大贏民進黨，替國民黨拿回執政權，當時臺灣內部普遍的看法也覺得民進黨二十年內無法上臺，但世事難料，形勢發展趕不上政治之變化，政治發展最難預料。從這次選舉來看，國民黨的問題當然非常嚴重，而且這些問題並非一日之寒，它是一個結構性的困境，國民黨不進行真正的改革未來發展前景很難樂觀。包括人才的培養機制、選舉人才在地化經營的機制以及理念的缺乏等等，都是嚴重制約國民黨再起的重大瓶頸。
 
三是民進黨雖然大勝，但也沒有多少值得驕傲的資本。當前整個國際經濟情勢不佳的大環境下，蔡英文當局仍然面臨發展經濟、提升民生等方面的重大考驗，如果未來在這方面無所建樹，仍然會面臨臺灣民意的檢驗。當然民進黨未來主要的挑戰還是在兩岸政策上。蔡英文在當晚的勝選感言中，提出了不挑釁、不意外等語言，至少在態度上展現出了一些積極的姿態，但其兩岸論述基本上還是其在選舉期間相關論述的重複而已，並無任何的新意。仍然是沿襲了過去一貫在兩岸政策上的模糊作風。而且由於民共之間的互信基礎全無，單憑蔡英文在獲勝感言中的幾句話顯然無法融化民共之間的堅冷厚冰。因此，對於蔡英文而言，如何維持一個穩定的兩岸關係和台海局面將是考驗其智慧和能力的關鍵指標。